draにデータをアップロードするときの覚書。ド素人でもなんとなくわかるように作成されていて素敵です。linuxから作業するのが断然楽ちんだと思う。メタデータの作成は省略。要は、ここに書いてあるとおりするだけみたい。 http://trace.ddbj.nig.ac.jp/file…

mysqlにsmrtanalysisがadmin idとして追加してやりゃいいんじゃね？ と思いついた。mysqlの初期設定方法とかを眺めていると、そういう指定があったから。 CentOS/MySQL/初期設定 http://tech.hitsug.net/?CentOS%2FMySQL%2F%E5%88%9D%E6%9C%9F%E8%A8%AD%E5%A…

Step 5 Details: (New Installations Only) Set Up SMRT® Portal どうやらブラウザで起動するらしい。アドレスは、 http://hostname:port/smrtportal ちょっと悩んだが、つまりは http://***.***.***.ac.jp:8080/smrtportal ですね。で、ついに ｷﾀﾜｧ:.｡..｡.:…

job management system ジョブ管理システム（ジョブかんりシステム）とは、複数のジョブ（プログラム、バッチ処理）の起動や終了を制御したり、ジョブの実行・終了状態の監視・報告などを行うソフトウェアである。「ジョブスケジューラ」、「タスクスケジュ…

そもそもDNSの付け方がわからん。ていうかこの苦行マジなんなの？ということで基礎から情報を仕入れる。1 DNS(hostname)のつけ方 http://homepage1.canvas.ne.jp/kabada/hostname/dns.html うーん。何でもいいからオンリーワンにしとけってことでいいんだろ…

ここからが鬼門でした。まずは再起動したので、もう一度 SMRT_ROOT=/opt/smrtanalysis これを入力。その後、解凍なしでのインストールを始める。 $ bash smrtanalysis-2.1.1-centos-6.3.run --rootdir $SMRT_ROOT --no-extract 何行か進んだのち、 Welcome t…

しかしまだまだ終わらない。・Minimum Hardware Requirements 今更どうしようもないので気にしない。一応クリアしてるはず。 ・Network File System Requirement さっぱりわからんのでスルー。で、真打ち。 ・Installation and Upgrade Summary 順番にやって…

apxsというのがそもそも謎。Please provideのすぐ上には、 Next we need to know where the 'apxs' script is located. This script provides a lot of information about the Apache installation, and makes it easier to find things on your system. Nor…

そもそもmysqlを一回も立ち上げていないのがまずいらしい。パスワードとか聞かれてもわからなさすぎるので、騙し騙しやってみる。まずは、インストール中の窓はそのままにして新しく端末を立ち上げてrootに。 http://nomnel.net/blog/install-mysql/ を参考…

とりあえず道しるべに書いてあるように進める。1 Operating System ・英語のOSしかダメよと書いてある 今インストールしているのは、CentOS6.5 (この前6.4からyum updateしたらこうなった）の日本語。CentOS6.3しかダメよと書いてあるが、練習なので気にしな…

スパコンの方がどうも打ち止め感が漂ってきたので、今度詳しそうな人に突撃かまして聞いてみることにしました。waitから先が動かない状態になっている（のような気がする）ので、何か怪しいことが起こっているはずです。ということで、ローカルPCにsmrtanaly…